Was ist der Unterschied zwischen 16s rRNA und 16s rDNA?

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Anonim

Die Hauptunterschied zwischen 16S rRNA und 16S rDNA ist das 16S rRNA ist ein Bestandteil der kleinen Untereinheit oder 30S Untereinheit im prokaryotischen Ribosom, während 16SrDNA das Gen ist, das 16S rRNA kodiert. Darüber hinaus nimmt 16S rRNA an der Bindung an die Shine-Dalgarno-Sequenz auf der zu translatierenden mRNA teil, während 16S rDNA eine Transkription durchläuft, um ihr Genprodukt, die 16S rRNA, zu produzieren. Darüber hinaus haben Prokaryonten mehrere Sequenzen von 16S rDNA pro Genom, und die 16S rDNA ist bei verschiedenen Bakterien- und Archaeenarten konserviert.

16S rRNA und 16S rDNA sind zwei Arten von Nukleotidsequenzen, die in Prokaryonten vorkommen. Im Allgemeinen sind sie dafür verantwortlich, die Translation von prokaryontischer mRNA zu erleichtern.

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Was ist 16S-rRNA?

16S rRNA ist eine Art von rRNA, die für den Aufbau der kleinen Untereinheit des prokaryotischen Ribosoms verantwortlich ist. Bezeichnenderweise beträgt die Größe der 16S-rRNA 1542 nt. Im Allgemeinen hat es eine ähnliche strukturelle Rolle wie die rRNA in der großen Untereinheit, um ribosomale Proteine ​​in definierten Positionen zu stützen. Darüber hinaus erleichtert es die Bindung der kleinen Untereinheit an die große Untereinheit, indem es mit der 23S-rRNA in der großen Untereinheit interagiert.

Abbildung 1: 16S-rRNA-Struktur

Darüber hinaus besteht die dreidimensionale Struktur der 16S rRNA aus vier Domänen. Außerdem enthält das 3'-Ende der 16S-rRNA eine Anti-Shine-Dalgarno-Sequenz, die an die Shine-Dalgarno-Sequenz der vom Ribosom zu translatierenden mRNA binden kann. Im Allgemeinen tritt diese Sequenz auf der mRNA um die acht Basen stromaufwärts des Startcodons AUG auf. Andererseits ist 16S rRNA für die Stabilisierung der Paarung von Codon und Anticodon in der A-Stelle des Ribosoms verantwortlich.

Was ist 16S rDNA?

16S rDNA ist das Gen, das 16S rRNA in Prokaryonten kodiert. Da jedoch die meisten der funktionell verwandten prokaryotischen Gene in Operons organisiert sind, kommt 16S rDNA zusammen mit den anderen beiden Genen, die für die Ribosomensynthese verantwortlich sind, auch in einem Operon vor. Grundsätzlich handelt es sich bei diesen anderen Genen um 23S rDNA- und 5S rDNA-Gene. Andererseits kann es im Genom eines Bakteriums mehr als eine Kopie der 16S rDNA geben.

Abbildung 2: Phytoplasma-rRNA-Operon

Ähnlichkeiten zwischen 16S rRNA und 16S rDNA

Unterschied zwischen 16S rRNA und 16S rDNA

Definition

16S rRNA bezieht sich auf eine Komponente der kleinen (30S) Untereinheit des prokaryotischen Ribosoms, während sich 16S rDNA auf das Gen bezieht, das die 16S rRNA in Prokaryoten kodiert.

Art der Nukleotide

Struktur

Während 16S rRNA aus vier Domänen besteht, ist 16S rDNA zusammen mit 23S- und 5S-rRNA-Genen in einem Operon organisiert.

Funktion

16S rRNA nimmt an der Bindung an die Shine-Dalgarno-Sequenz auf der zu translatierenden mRNA teil, während 16S rDNA eine Transkription durchläuft, um ihr Genprodukt, die 16S rRNA, zu produzieren.

Bedeutung

Darüber hinaus erleichtert 16S rRNA die Bindung von kleinen und großen Untereinheiten durch Wechselwirkung mit der 23S rRNA Untereinheit, während die 16S rDNA Sequenz für die Identifizierung von Prokaryoten wichtig ist.

Abschluss

16S rRNA ist der rRNA-Typ, der die kleine Untereinheit des prokaryotischen Ribosoms bildet. Es spielt eine strukturelle Rolle bei der Bindung mit der großen Untereinheit des prokaryotischen Ribosoms. Es bindet auch an die Shine-Dalgarno-Sequenz auf der zu translatierenden mRNA und initiiert die Translation. Die 16S rDNA hingegen ist die Gensequenz im Genom, die für 16S rRNA kodiert. Im Allgemeinen tritt dieses Gen kooperativ mit den 23S- und 5S-rRNA-Genen im gleichen Operon auf. Darüber hinaus können im Genom von Prokaryonten mehrere Kopien derselben Gensequenz vorkommen. Daher ist der Hauptunterschied zwischen 16S rRNA und 16S rDNA ihre Funktion.

Verweise:

1. „16S Ribosomale RNA.“ Wikipedia, Wikimedia Foundation, 14. Oktober 2019, hier verfügbar.2. Chatellier, S., et al. „Vergleich zweier Ansätze zur Klassifizierung von 16S-RRNA-Gensequenzen.“ Zeitschrift für medizinische Mikrobiologie, vol. 63, nein. Pt_10, 2014, S. 1311–1315., doi:10.1099/jmm.0.074377-0.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. „16S“ von Squidonius – Eigene Arbeit (Public Domain) über Commons Wikimedia 2. „Amit Yadav Phytoplasma rRNA Operon“ (CC BY-SA 3.0) über Commons Wikimedia

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