Eine Plasmidkarte ist die relative Position der Elemente innerhalb des Plasmids. Eine Plasmidkarte kann gelesen werden, indem man die Merkmale des Plasmids versteht. Dies sind der Name und die Größe des Plasmids, die Elemente des Plasmids, ihre relativen Positionen und die Orientierung des Promotors. Der Replikationsursprung (ORI), das Antibiotikaresistenzgen, die multiple Klonierungsstelle (MCS), das Insert oder das interessierende Gen, die Promotorregion, der selektierbare Marker und die Primerbindungsstelle sind die Elemente eines Plasmids. Die relativen Positionen der Elemente in einem Plasmid können durch Kartierung des Plasmids bestimmt werden. Der bei der Kartierung von Plasmiden beteiligte Prozess wird als Restriktionskartierung bezeichnet.

Abgedeckte Schlüsselbereiche

1. Was ist eine Plasmidkarte? – Definition, Restriktionszuordnung 2. Wie man eine Plasmidkarte liest – Merkmale einer Plasmid MapP

Schlüsselbegriffe: Elemente, Name und Größe des Plasmids, Orientierung des Promotors, Plasmidkarte, Restriktionsenzyme, Restriktionskartierung

Was ist eine Plasmidkarte?

Eine Plasmidkarte ist eine grafische Darstellung eines Plasmids, die die Orte der wichtigsten Orientierungspunkte oder Elemente des Plasmids zeigt. Die relativen Positionen von Elementen innerhalb eines Plasmids können identifiziert werden durch Restriktionszuordnung. Eine Restriktionskarte ist eine Karte von Restriktionserkennungsstellen innerhalb eines bestimmten Plasmids. Daher ist es am Verdau des Plasmids durch Restriktionsenzyme beteiligt. Eine Restriktionskarte ist in Abbildung 1 dargestellt.

Abbildung 1: Restriktionskarte

Beim Restriktions-Mapping können zwei Methoden verwendet werden:

1. Restriktionsverdauung

– Restriktionsverdau des Plasmids mit einem oder zwei Restriktionsenzymen

– Kartierung des Plasmids anhand der Größe der aus dem Plasmid resultierenden Fragmente

2. Sequenzierung

– Sequenzierung des gesamten Plasmids

– Identifizierung der Elemente des Plasmids

So lesen Sie eine Plasmidkarte

Abbildung 2: Plasmidkarte

Das Lesen einer Plasmidkarte konzentriert sich hauptsächlich auf die Merkmale des Plasmids. Sie sind;

1. Name und Größe des Plasmids

2. Die Elemente eines Plasmids –

3. Die relativen Positionen der Elemente innerhalb des Plasmids

4. Die Ausrichtung des Promoters

Abschluss

Eine Plasmidkarte kann gelesen werden, indem man die Merkmale der Plasmidkarte versteht, wie den Namen und die Größe des Plasmids, die Art der Elemente im Plasmid und ihre relativen Positionen und die Orientierung des Promotors.

Referenz:

1. „Was ist ein Plasmid?“ Addgene, hier erhältlich.

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. „PDONR221 Map“ von Nothingserious – Analysesequenz: pDONR221. Addgen. Abgerufen am 24. Januar 2016 (CC0) über Commons Wikimedia 2. „PGEX-3X-Klonierungsvektor“ von Magnus Manske – Erstellt von Magnus Manske (CC BY-SA 3.0) über Commons Wikimedia