Unterschied zwischen selektierbarem Marker und Reportergen
Inhaltsverzeichnis:
- Was ist ein auswählbarer Marker?
- Was ist ein Reportergen?
- Ähnlichkeiten zwischen selektierbarem Marker und Reportergen
- Unterschied zwischen auswählbarem Marker und Berichtsgen
Die Hauptunterschied zwischen selektierbarem Marker und Reportergen ist, dass die selektierbarer Marker wird verwendet, um zwischen Transformanten und Nicht-Transformanten zu unterscheiden, während das Reportergen verwendet wird, um das Expressionsniveau des transformierten Gens zu messen. Darüber hinaus hat das selektierbare Markergen seinen eigenen Promotor, während die Expression des Reportergens durch den Promotor des transformierten Gens reguliert wird.
Selektierbares Maker- und Reportergen sind zwei Arten von Genen, die verwendet werden, um Transformanten in den Studien zu analysieren, die transgene Organismen produzieren.
Genexpressionsanalyse, interessierendes Gen, Reportergen, selektierbarer Marker, Transformanten
Was ist ein auswählbarer Marker?
Ein selektierbarer Marker ist eine Art von Markergenen, die im Allgemeinen im Plasmid lokalisiert sind. Es wird mit Hilfe des Plasmids in die Wirtszelle transformiert. Die Transformanten, die den selektierbaren Marker enthalten, können in dem entsprechenden selektierbaren Medium wachsen. Aber die Nicht-Transformanten, denen der selektierbare Marker fehlt, können in diesem selektierbaren Medium nicht wachsen. Dies bedeutet, dass das Genprodukt des selektierbaren Markers zum Selektionsfaktor für das Überleben wird.
Die drei Gruppen selektierbarer Marker sind Antibiotikaresistenzgene, Antimetabolitenmarkergene und Herbizidresistenzgene. Die am häufigsten verwendeten selektierbaren Marker sind die Antibiotikaresistenzgene. Daher können nur die Transformanten in dem Medium wachsen, das das entsprechende Antibiotikum enthält.
Wählbarer Marker
Abbildung 1: Rolle antibiotikaresistenter Gene beim molekularen Klonen
Jedoch enthalten möglicherweise nicht alle Transformanten das interessierende Gen. Einige Transformanten können nur den Vektor mit dem selektierbaren Marker aufweisen. Die Sequenzierung oder Genexpressionsanalyse erlaubt nur den Nachweis von Rekombinanten, die das interessierende Gen aufweisen.
Was ist ein Reportergen?
Reportergene sind Markergene, die zur Quantifizierung der Genexpression verwendet werden. Sie sind an die regulatorische Sequenz des interessierenden Gens fusioniert. Neben der Analyse der Expression des interessierenden Gens ermöglichen Reportergene die Untersuchung der Funktion der Genregulationselemente und der Wirkung von Transkriptionsfaktoren auf die Genexpression. Reportergene sind auch bei der Identifizierung der gewebespezifischen oder bahnspezifischen Genexpression von entscheidender Bedeutung.
Abbildung 2: Rolle des Reportergens
Grün fluoreszierendes Protein (GFP) und Luciferase sind die häufigsten Arten von Reportergenen. GFP ist ein leuchtendes Protein unter UV-Licht. Die Anwesenheit anderer fluoreszierender Proteine wie rot- und gelb fluoreszierender Proteine ermöglicht die Identifizierung verschiedener Proteine im selben System. Luciferase ist ein Enzym, das die Produktion von gelbgrünem oder blauem Licht aus dem Substrat Luciferin katalysiert.
Ähnlichkeiten zwischen selektierbarem Marker und Reportergen
Unterschied zwischen auswählbarem Marker und Berichtsgen
Definition
Der selektierbare Marker bezieht sich auf ein Gen, dessen Expression es ermöglicht, Zellen zu identifizieren, die mit einem das Markergen enthaltenden Vektor transformiert oder transfiziert wurden, während sich das Reportergen auf ein Gen bezieht, das verwendet wird, um ein anderes Gen oder eine DNA-Sequenz von Interesse zu "markieren", wie z ein Promoter.
Bedeutung
Ein selektierbarer Marker hilft, zwischen Transformanten und Nicht-Transformanten zu unterscheiden, während das Reportergen hilft, die Expressionsmenge des transformierten Gens zu messen.
Promoter
Der selektierbare Marker hat seinen eigenen Promotor, während das Reportergen unter dem Promotor des transformierten Gens reguliert wird.
Standort
Der selektierbare Maker kann sich im Plasmid oder innerhalb des Genkonstrukts befinden, während sich das Reportergen zwischen dem Promotor und dem interessierenden Gen befindet.
Ergebnis
Transformierte Zellen mit dem selektierbaren Maker können in dem selektierbaren Medium wachsen, aber die Nicht-Transformante kann nicht wachsen, da ihnen der selektierbare Marker fehlt, während die Menge des Genprodukts im Reportergen von der Menge der erfolgreich transformierten interessierenden Gene abhängt.
Beispiele
Antibiotikaresistenzgene, Antimetabolitmarkergene und Herbizidresistenzgene sind die Arten von selektierbaren Markern, während GFP und Luciferase einige Reportergene sind.
Abschluss
Die selektierbaren Marker sind die Markergene, die zum Screenen von Transformanten in dem entsprechenden selektierbaren Medium verwendet werden, während die Reportergene Markergene sind, um das Ausmaß der Expression zu messen. Der Hauptunterschied zwischen selektierbaren Marker- und Reportergenen ist die Art des Screenings.
Referenz:
1. Jha, Nandkishor. „Auswählbare Markergene und Reportergene.“ Biologiediskussion, 16. Okt. 2015, hier verfügbar2. „Reporter-Gen-Assays.“ Thermo Fisher Scientific, Thermo Fisher Scientific, hier erhältlich
Bild mit freundlicher Genehmigung:
1. „Schritte des molekularen Klonens“ von Alexpicardal97 – Eigene Arbeit (CC BY-SA 4.0) über Commons Wikimedia 2. „Reportergen“ von TransControl bei en.wikipedia (CC BY-SA 3.0) über Commons Wikimedia