sgRNA ist die Single Guide RNA, ein Begriff, der zur Beschreibung von gRNA verwendet wird, während gRNA die Guided RNA ist, ein RNA-Molekül, das verwendet wird, um ein bestimmtes Ziel für die Endonukleasen in der CRISPR-System-basierten Genom-Editierung zu spezifizieren. Deswegen, sowohl sgRNA als auch gRNA sind austauschbare Begriffe, die verwendet werden, um dasselbe Molekül zu beschreiben. Es gibt keinen großen Unterschied zwischen sgRNA und gRNA.

Sowohl sgRNA als auch gRNA sind synthetische Moleküle und ähneln in ihrer Funktion der crRNA im CRISPR-System.

Cas, CRISPR-basierte Genom-Editierung, gRNA, sgRNA, Spacer-Sequenz

Was ist sgRNA

sgRNA (Single Guide RNA) ist ein anderer Begriff zur Beschreibung von gRNA.

Abbildung 1: sgRNA

Was ist gRNA

gRNA (Guide RNA) ist ein kurzes, synthetisches RNA-Molekül, das in der auf dem CRISPR-System basierenden Genom-Editierung verwendet wird, einer der hochspezifischen Arten von Genommodifikationswerkzeugen. gRNA besteht aus einer ~20 bp langen Nukleotidsequenz, die an eine Ziel-DNA-Sequenz des Genoms bindet. Diese Folge heißt Spacer-Sequenz. Das gRNA-Molekül besteht aus einer Gerüstsequenz zur Bindung von Cas, der Endonuklease. Die beiden Komponenten der CRISPR-basierten Genom-Editierung sind also die gRNA und die CRISPR-assoziierte Endonuklease (Cas). Andererseits verändert sich das Genom-Target des CRISPR-Systems mit der Sequenz der gRNA.

Abbildung 2: gRNA-Rolle bei der Genom-Editierung

Basierend auf der Synthesemethode gibt es drei Arten von gRNAs. Sie sind die synthetische crRNA, lentivirale sgRNA und synthetische sgRNA.

Ähnlichkeiten zwischen sgRNA und gRNA

Unterschied zwischen sgRNA und gRNA

Definition

sgRNA (single guide RNA) bezieht sich auf die im künstlichen CRISPR-System verwendete gRNA, während sich gRNA (Guide RNA) auf die kurzen, synthetischen RNA-Sequenzen bezieht, die die Zielsequenz für die CRISPR-basierte Genom-Editierung angeben.

Abschluss

sgRNA ist ein anderer Begriff für gRNA, während gRNA die kurzen, synthetischen RNA-Sequenzen ist, die verwendet werden, um die Zielsequenz im Genom für die Endonuklease im CRISPR-System zu spezifizieren. Sowohl sgRNA als auch gRNA sind Bestandteil der CRISPR-basierten Genom-Editierung. Daher besteht der Hauptunterschied zwischen sgRNA und gRNA nur in der Terminologie.

Referenz:

1. „CRISPR-Leitfaden“. Addgene: CRISPR-Leitfaden, hier erhältlich

Bild mit freundlicher Genehmigung:

1. „15 Hegasy Cas9 DNA Tool Wiki E CCBYSA“ Von Guido4 – Eigene Arbeit (CC BY-SA 4.0) über Commons Wikimedia 2. „CRISPR-Cas9-biologist“ Von J LEVIN W – Eigene Arbeit (CC BY-SA 4.0) über Commons Wikimedia